現在、支払方法はすべて後払いにしているのですが、
「入金待ち注文一覧」＞「詳細」＞「注文状況を変更する」＞「入金待ち（後払い）」に変更
商品発送
＞「注文状況を変更する」＞「入金済」
にすると「売上管理」に反映されてない様に思うのですが・・・。
今回後払いなので、「入金待ち注文一覧」＞「入金処理」をすると入金確認メールが自動送信してしまうので上記方法で行いました。
ほかに対応方法がありましたでしょうか。
「発送処理」は行われましたでしょうか？
（または、注文詳細変更において、発送済みにし、発送日を入力されましたでしょうか？）
店舗様によっては、入金処理をしない店舗もございます。
納品（＝発送処理）を完了すると、売上管理へ反映される仕様となっております。